Nios® II IDE는 특정 조작 중에 SOPC 빌더를 호출하며, 이로 인해 시스템이 수정되지 않은 경우에도 SOPC 빌더가 PTF 파일의 날짜 스탬프를 변경할 수 있습니다. 이 동작은 버전 제어 시스템을 사용하는 경우 문제가 발생할 수 있습니다.
이 문제를 해결하기 위해 PTF 파일 특성을 읽기 전용으로 변경하여 Nios II IDE가 파일을 변경하지 못하도록 할 수 있습니다. 그러나 Nios II C2H 컴파일러를 사용하는 경우 PTF 파일에 대한 읽기 쓰기 권한이 필요합니다.