유전자 연구의 가속화

인텔과 Broad Institute는 강력하고 유연한 유전자 분석용 데이터 센터 솔루션을 개발하기 위해 협력하고 있습니다.

유전자 데이터 엔지니어링을 위한 Intel-Broad 센터

유전자 데이터 엔지니어링을 위한 Intel-Broad 센터의 연구자와 소프트웨어 엔지니어들은 과학자들이 유전자 데이터를 통합 및 처리할 수 있도록 새로운 도구와 인프라를 개발하고 최적화하여 널리 공유하고 있습니다. 이 프로젝트를 통해 유전체 분석을 위한 하드웨어 및 소프트웨어의 모범 사례가 최적화되어 프라이빗, 퍼블릭 및 하이브리드 클라우드에 존재하는 연구 데이터를 결합하고 사용하는 것이 가능해집니다. 프로젝트의 목표는 전 세계 연구자들이 과거에는 활용할 수 없었던 데이터에 빠르게 접근하여 강력한 결과를 도출할 수 있도록 지원하는 것입니다.

인텔과 Broad가 제공하는 Genomics Stack

인텔과 Broad Institute는 보다 간편한 오픈 소스 구축을 통해 전례 없는 규모로 Broad의 Genome Analysis Toolkit을 더욱 빠르게 실행할 수 있는 새로운 통합 하드웨어 및 소프트웨어 솔루션 을 선보입니다. 아래에서 솔루션 파트너들을 확인해보십시오.

새로운 발견을 위한 공통의 비전

세계 각지의 연구자들이 풍부한 인사이트를 통해 인류의 건강을 개선할 수 있도록 지원한다는 사명을 갖고 있습니다.

Anthony Philippakis, M.D., PH.D., Broad Institute의 CDO(최고 데이터 책임자)가 인텔-Broad의 협업에 대해 설명합니다.

유전자 분석에 대한 비전

의료 및 생명 과학 분야를 이끄는 최신 아이디어

Broad-Intel Genomics Stack*(BIGstack*)

Broad-Intel Genomics Stack*(BIGstack*)으로 유전자 연구와 전유전체 시퀀싱이 어떻게 발전하고 있는지 알아보십시오.

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유전자 연구를 촉진하는 OpenCL™과 FPGA

인텔과 Broad Institute는 GATK의 HaplotypeCaller 알고리즘을 실행하는 FPGA와 OpenCL™로 유전자 연구 분야의 발전을 앞당기고 있습니다.

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전산유전체학과 분석을 지원하는 인텔® 셀렉트 솔루션

인텔과 Broad Institute는 하드웨어 및 소프트웨어 솔루션을 통해 전산유전체학과 분석의 발전을 앞당기고 있습니다.

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GKL 압축

GKL 압축 최적화 적용 시 성능이 최대 2.8배까지 향상됩니다.

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GATK*용 인프라

GATK* 유전자 분석에 대한 하드웨어 및 소프트웨어의 모범 사례를 구현합니다.

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FPGA 가속

FPGA를 활용할 경우 Haplotype 호출/PairHMM 함수의 성능이 크게 개선됩니다.

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전유전체 분석

전유전체 변이 분석 성능의 가속을 위한 인텔 클러스터 기반 아키텍처입니다.

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유전자 데이터를 희소 기둥 배열로 저장

GenomicsDB는 유전자 변형체 등에 사용되는 스토리지 기술입니다.

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의료 및 생명 과학 블로그의 최신 논의 보기


개발자를 위한 자료

유전자 분석 최적화를 위한 오픈 소스 프레임워크와 도구 뿐만 아니라 구현, 벤치마킹, 맞춤화를 위한 코드 및 레퍼런스 아키텍처를 활용해 보십시오.

유전체 분석 툴킷*

업계 최고의 분석 솔루션이 이제 주요 지원 구성 요소가 번들로 함께 제공되므로 구현이 더욱 쉬워집니다.

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GATK* 받기

Cromwell

Broad의 WDL(Workflow Description Language) 기반 실행 관리 엔진입니다. 오픈 소스 기반으로 뛰어난 유연성을 자랑하며, 로컬 작업이나 클라우드 작업에 적용 가능합니다.

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Cromwell 받기

Genomics Kernel Library*

64비트 Linux* 및 Mac OS X* 하의 인텔® 아키텍처에 최적화된 컴퓨팅 커널입니다. PairHMM용 커널, igzip 압축 및 otc_zlib 압축이 포함되어 있습니다.

GKL 받기 및 자세한 내용 보기

GenomicsDB

유전자 변이 데이터 관리에 최적화된 희소 데이터 어레이입니다.

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GenomcsDB 받기

Lustre*

HPC 빅 데이터 워크로드를 위한 병렬 파일 시스템입니다. Lustre* 소프트웨어용 인텔® 솔루션이 포함되어 있습니다.

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HTCondor

HPC를 위한 워크로드 관리, 작업 큐잉, 스케줄링, 우선 순위 지정, 리소스 모니터링 및 리소스 관리를 수행할 수 있습니다.

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인텔® Omni-Path 아키텍처

저지연 저전력의 높은 처리량을 지원하는 고성능 데이터 센터 통신 아키텍처입니다.

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인텔® Omni-Path 소프트웨어 받기

인텔® 스케일러블 시스템 프레임워크 (인텔® SSF)

인텔® 확장형 시스템 프레임워크(인텔® SSF)는 HPC의 새로운 흐름에 발맞춰 인텔의 최신 컴퓨팅, 메모리 및 스토리지, 패브릭, 소프트웨어 기술을 통합합니다.

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Broad Intel Genomics Stack은 인텔의 최신 컴퓨팅, 패브릭, 메모리 및 스토리지 기술을 바탕으로 GATK*를 실행하는 통합 솔루션입니다.

인텔® 제품

인텔® 제온® 프로세서 E5 제품군

기존 서버급 인프라에서 높은 처리량을 기록했습니다.

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인텔® 제온 Phi™ 프로세서 제품군

견고하고 확장 가능한 인프라에서 심층 신경망 교육 시간을 단축할 수 있습니다.

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